泥炭已经成为育苗基质的主要成分之一，各种各样的育苗基质都在使用这种效果良好的材料。日益增多的需求使得泥炭的生产厂家看到了商机。为了提高效益，许多泥炭生产厂家采用粗放式开采，从而提高产量。但是，这样做的弊端就是直接导致育苗基质中可能存在病菌或虫卵，若长期使用，尤其是连作的情况下，会使病菌和虫卵聚集，从而发生病虫害，这对植物的培养是很不利的。因此，使用前的消毒已经成了必要的步骤，消毒后的育苗基质，才是好基质。

为了保证消毒的有效性，一般情况，配置育苗基质过程中就要开始消毒的步骤了。基质使用前和作物收获后，都需要对基质进行消毒，以保证下一次使用时能消灭可能存留的病菌和虫卵。蒸汽消毒和化学药剂消毒是常用的两种方法。

蒸汽消毒的步骤简单安全，但需要引进专用的设备，增加成本，操作不便，可是它的灭菌效果还是非常好好的；化学药剂消毒一般使用甲醛或高锰酸钾，虽然成本低，但是消毒效果不如蒸汽消毒，而且可能对操作人员的身体有影响。因此，选择哪种消毒方法要根据实际情况来定。

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